AI“撞”醫藥丨科創要聞
隨著AI(人工智能)出現、發展,尋找基因圖片、改變人類命運的齒輪也開始轉動。
責任編輯:黃金萍
破解遺傳密碼、尋找基因突變,是人類理解生命的終極問題之一。
人類基因組擁有數以千計的基因,可能的基因突變更是達到百萬級別?;蛲蛔?,因基因序列發生變化而改變遺傳信息的過程,可能導致遺傳疾病的發生、癌癥的形成等變化。此前,測序技術、比較基因組學、PCR(聚合酶鏈式反應,放大擴增特定的DNA片段)技術等方法在尋找基因突變方面已經取得了很大的成功,但仍如同大海撈針。
隨著AI(人工智能)出現、發展,尋找基因圖片、改變人類命運的齒輪也開始轉動。
9月19日,Google DeepMind在《科學》(Science)上發表題為Accurate proteome-wide missense variant effect prediction with AlphaMissense的文章,介紹了基于蛋白質結構預測工具AlphaFold2的最新AI工具AlphaMissense,用于預測全基因組錯義突變的致病性。
錯義突變(missense variant),指DNA中的堿基替換導致蛋白質內產生不同的氨基酸。在觀察到的400多萬個錯義變異中,只有約2%在臨床上被歸類為致病性或良性,而其中絕大多數具有未知的臨床意義。
而在上述論文中,AlphaMissense 能根據基因預測相關的蛋白質序列,通過對人類和靈長類變異種群頻率數據庫進行微調,以預測錯義變異的致病性。研究人員共預測了19233種典型人類蛋白質中單氨基酸變化的致病性,從而推斷出7100萬個可能的錯義突變;隨后,對其中89%的錯義變體進行分類,預測出57%可能是良性的、32%可能是病原性的。
AlphaFold讓蛋白結構精確預測變得可能,AlphaMissence讓錯義突變的功能預測變得更加精準,這些預測可幫助臨床醫生對變異基因優先排序,診斷疾病。
AI在醫藥領域的應用如同流星雨般不斷降落,帶來了一個個驚喜。更令人振奮的是,這場“流星雨”才剛剛啟幕。
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網絡編輯:孫顯安 校對:胡曉