基因測序追蹤超級細菌源頭

全基因組測序技術可以幫助研究人員追蹤MRSA、克雷伯氏菌等超級細菌的源頭，同時也為尋找抑制它們的藥物或療法提供了線索。

耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）、克雷伯氏菌等細菌能引起多種疾病和感染，同時各種抗生素往往又對它們無可奈何，這些令人色變的細菌因而被稱為超級細菌。幸運的是，近年來，研究人員已經能用全基因組測序技術追蹤這些細菌的源頭，同時也為尋找抑制它們的藥物或療法提供了線索。

羅西醫院的MRSA感染

2011年6月，美國馬里蘭州貝塞斯達國立衛生研究院（NIH）臨床中心發生了克雷伯氏菌感染導致6人死亡的嚴重事故。該臨床中心利用全基因組測序技術追蹤到了克雷伯氏菌的來源。事后，英國劍橋大學微生物學家沙龍·匹考克（Sharon Peacock）對這一事件做出了積極評價：全基因組測序技術對疫情調查和監測具有潛力。

沒想到匹考克等人不久就成為追蹤超級細菌MRSA起源的主角。

2011年底，英國劍橋市羅西醫院的醫生發現，該院嬰兒特別監護室中的3名嬰兒相繼染上MRSA?？只烹S即開始在醫院蔓延。從3名嬰兒身上分離出MRSA后，高度緊張的醫護人員馬上打掃了病房，并徹底消毒，以期切斷傳染源。

但是羅西醫院的MRSA感染并沒有就此結束。在病房殺菌消毒后幾天，又有1名嬰兒的MRSA檢測結果呈陽性。檢測結果顯示，3名嬰兒染上MRSA的同時，至少還有另外8名兒童感染了相似耐藥性的MRSA菌株。但是，這些染上MRSA的兒童在幾周內都沒有出現感染癥狀，這似乎說明，感染這8名兒童的MRSA可能并非來自這3名嬰兒或嬰兒的病房。

到2012年3月，匹考克的研究小組請纓領命，試圖追蹤造成羅西醫院廣泛感染的MRSA究竟來自何處。匹考克小組對取自這所醫院嬰兒身上的MRSA菌株與取自其他醫院成年患者相似的MRSA菌株進行全基因組測序，并進行比較，結果讓人吃驚，嬰兒病房的MRSA菌株與其他疑